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代谢组学

 

8月17日,由阿趣生物(以下简称BIOTREE)与Sartorius Stedim 联合举办的第22期代谢组学及数据分析培训班在广州正式拉开了序幕。

BIOTREE全体员工在这里对70余位来自全国各地的代谢组学研究领域的学员表示最衷心的感谢和热烈的欢迎。

 

接下来让我们一起来围观一下本次培训班的精彩进程吧~

 

开班致辞

 

代谢组学

 

BIOTREE CEO 邓军亮老师回顾BIOTREE自2012年创办以来,在今年已步过第8个年头。在这八年之间, BIOTREE由三个人的创业集合成长为一个超百人的专业科研团队,并通过开办培训班培养了行业内近1000名的储备人才。

 

于此同时, 由BIOTREE独家引进的大数据分析标杆产品SIMCA 16版本已正式上线,增加新技术MOCA (Mulitiblock Orthogonal Component Analysis)可实现多组学数据联合分析。同样欢迎大家来多多了解由BIOTREE和南京扬子科创合作打造的全球顶级质谱检测中心的实时资讯。

 

BIOTREE从一个几十平米的租赁小屋发展到拥有超千平米上下3层的成熟生物医学科技公司。

 

我们非常荣幸能遇到大家,感谢大家这一路上的信任与支持。

 

初心不忘,我们仍在路上。

 

代谢组学及多元变量统计分析

 

本期“代谢组学及多元变量统计分析”课程(8月17日-8月18日),BIOTREE很荣幸地邀请到代谢组学领域的知名专家:厦门大学冯江华老师、香港中文大学于君老师、江南大学纪剑老师,以及BIOTREE各位资深技术老师前来授课。

 

01

嘉宾:冯江华

厦门大学教授

 

简介:

冯江华老师先后在法国国家科研中心(CNRS)格勒诺布尔生物结构研究所和英国曼彻斯特大学进行博士后研究工作。长期致力于代谢组学在生命科学领域的应用、食品安全和质量控制。发布SCI 20余篇,被他引和正面评价两百余次。承担包括国家自然科学基金、“十一五”国家科技支撑计划等多项科研项目。

 

代谢组学

 

主题:代谢组学概述与发展

本次课程中,冯江华老师从代谢物的定义、代谢组学的发展、各组学之间的比较、代谢组学的研究流程、检测技术仪器、以及在生命科学中的研究领域(毒理研究、药物代谢及安全性评价、病理诊断及生理学等)多个方面诠释了代谢组学在如今社会上的发展、应用与贡献。

 

02

嘉宾:于君

香港中文大学教授

 

简介:

于君老师在香港中文大学医学消化道肿瘤实验担任中心主任。长期致力于消化系统肿瘤机制和防治研究,包括肠道微生态和肿瘤的研究10多年,获奖三十余项。发表SCI论文350多篇,影响因子10以上76篇;20以上14篇,包括: Nature、Nature Biotechnology、Cancer cell、Cell Metablism、J Clin Oncol、Sci Transl Med、JCI、Mol  Cell、Gastroenterology、 Hepatology、 Gut、 Nat Commun 等。

 

代谢组学

 

主题:肠道菌群与消化道肿瘤

本次课程中,于君老师详细介绍了代谢组学在肠道菌群研究上的应用。同时,通过列举很多相关致病、诊断、及发展状态等相应的实例数据来分享消化道及肝脏病变、肿瘤的形成机理、如何更准确和有效的检测、预防和治疗方法。此外,本次培训中于君老师还为大家展示很多关于肠道菌群的最新研究结果和方向。

 

03

嘉宾:刘志鹏

BIOTREE 资深研究员

 

简介:

刘志鹏老师拥有多年代谢组学和多组学研究经验,目前主要从事多组学在人体大数据大健康的研究转化工作。曾参与多项国自然、973、载人航天工程等重大项目。先后在Nature Medicine、Nature Communications 等国际知名核心期刊上发表SCI论文5篇,申请受理国际PCT发明专利5项,已授权国际PCT专利1项,获得国际基因工程机械大赛iGEM金奖2项,参编完成“十三五”规划教材1部。

 

代谢组学

 

主题:代谢物溯源在肠道微生态中的研究应用

本次课程中,刘志鹏老师讲述了宏基因组学的定义、肠道微生物代谢及其发展趋势和取得的成就。重点介绍了肠道微生物通过产生相应代谢物后发挥的作用,并以案例分享的方式对研究肠道微生物代谢物的方法与思路进行了诠释。同时,就排泄物采集、检测处理方式和相应检测形式都进行了详细的讲解与阐述。

 

04

嘉宾:袁晓芳

BIOTREE 技术支持主管

 

简介:

袁晓芳老师毕业于韩国亚洲大学,研究方向为微生物代谢组学在代谢工程中的应用。专注于代谢组学领域,长期负责代谢组学前期技术咨询、后期数据分析、技术解答等工作,在微生物及植物代谢组学研究领域有丰富的经验。

 

代谢组学

 

主题:代谢组学样本收集与前处理方法

本次课程中,袁晓芳老师主要介绍了代谢组学研究中的样本收集与处理方法。她从不同的样本类型入手,深入且细致地介绍:样本分类、常见的收集方法和遇到的问题、样本收集过程中的通用原则、样本储存及寄送注意事项。同时列举了样本收集处理寄送的实例为大家提供更加明确且真实的操作讲解。

 

05

嘉宾:吴洪强

BIOTREE 技术总监

 

简介:

吴洪强老师担任重庆大学硕导,有多年质谱检测分析经验,熟悉各仪器平台及技术,擅长技术开发,主导了MAPS-代谢组学分析平台构建解决方案的系统开发。拥有发明专利1项,实用新型专利5项。

 

代谢组学

 

主题01_非靶标、靶标、高通量靶标、及广泛靶标技术简介:

吴洪强老师为大家深入介绍了多种代谢组学技术的详解与对比(包括非靶标、靶标、高通量靶标、广泛靶标)从硬件的色谱-质谱联用仪,物质偏好(气态、液态或重叠)到各个代谢组学的研究技术的详细方法、难点、应用方向都一一进行了阐述与举例。

 

主题02_MAPS-代谢组学分析平台构建全流程解决方案:

吴洪强老师全面介绍了MAPS系统的构架原理:从样本到数据采集、到数据库、生信分析全流程覆盖。随后由杜杰老师为大家讲解数据处理、统计分析、功能分析等的理论和相关操作注意事项。

 

06

嘉宾:纪剑

江南大学副研究员

 

简介:

纪剑老师是美国国立卫生研究院西海岸代谢组学研究中心联合培养博士。主要研究方向为基于GC-MS平台的代谢组学技术研究和质谱数据分析等。目前在国际杂志发表SCI论文十几篇,申请国家发明专利4项。

 

代谢组学

 

主题:GC-MS代谢组学下机数据分析

本次课程中,纪剑老师就GC-MS代谢组学的下机数据分析流程进行了详尽的数据讲解,其包括:CG-MS原始数据、数据类型及格式转换、噪音及基线矫正、提峰与解卷积、锋对齐、空值填补、及物质定性等。每个流程中都例举了相应的优化数据的方法与实例以进行更全面的诠释。

 

07

嘉宾:杜杰

BIOTREE 生物信息经理

 

简介:

杜杰老师参与过国内近百家科研单位代谢组学和蛋白组学平台,协助客户发表文章20多篇。专注于代谢组学和蛋白组学科研领域,擅长组学间数据关联分析、统计建模和生物学意义信息挖掘,在临床、医药、发酵等科研方向有多年的项目实战经验。

 

代谢组学

 

主题:多元变量统计分析

本次课程中,杜杰老师就大数据与多元变量统计的重要性进行了详细的解读与阐述。对大数据的定义及3大特点、SIMCA系统的演化更新、代谢组学数据分析流程进行了详尽的实例分析与答疑。最后杜杰老师指导参加本次培训的学员们进行了SIMCA软件的实际操作流程演练,使学员们初步掌握了SIMCA软件的运用。

 

至此,阿趣课堂的“代谢组学及多元变量统计分析”已圆满结束。

但精彩仍会继续。

 

中高阶实操课程

 

江南大学纪剑老师为大家带来:

 

代谢组学

 

GC/LC原始数据预处理实操分析课程(8月19日)

实操理论课程内容包括:GC-MS和LC-MS非靶标下机数据分析、介绍常见的用于下机数据分析的软件、针对MS DIAL做详细的软件分析和数据演练。

 

代谢通路网络构建分析(8月20日)

实操理论课程内容包括:MetaMapp功能介绍及代谢通路分析、Cytoscape功能介绍及代谢通路分析。

 

BIOTREE生物信息经理杜杰老师为大家带来:

 

代谢组学

 

可视化制图(8月21日)

实操课程内容包括:层次聚类热力图、pathway实战分析、ROC曲线、箱式图。

 

MVDA for Research(8月22-8月23)

实操课程内容包括:PCA/OPLS-DA/PCA-Class、O2PLS模型的建立与解读、潜在小分子生物标记物发现、多组学关联模型分析。

 

结语

直至今天(8/23),第22期阿趣课堂已圆满结束。

 

授课老师们分别围绕代谢组学发展史及技术介绍、消化道肿瘤研究、肠道菌群、样本采集及预处理、多元变量统计分析、SIMCA数据分析、及各项实操指导等多个方面对代谢组学及相关领域进行了全方位的解析。理论知识与经典案例加以结合,更加充分地让学员们理解和掌握代谢组学科研方面的核心要点、操作流程及注意事项。

 

感谢大家怀着一个空杯的心态和BIOTREE一同度过了一周的学习时光。相信大家在这样一个干货满满的培训课程中,定是学有所得,望大家在之后的学习研究中可以得有所用,用有所成。

 

再次感谢各位授课老师的莅临与悉心讲解以及各位学员的不辞辛苦的到来;希望有机会再和大家一起交流学习。

 

精彩仍会继续,期待与您的再次相见!!!

 

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欢迎大家加入BIOTREE;

学完我们所有培训课程的学员可以免面试入职。(笔芯~)

 

代谢组学

 


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